2006年09月07日

JOELibでAtomTypeの変換

JOELibでは、JOETypeTableクラスを使うことにより、AtomTypeの変換を行うことができます。例として、mol2形式のAtomTypeである'N.3'をmm2形式のAtomTypeへと変換してみます。

 JOETypeTable jtt = JOETypeTable.instance();
 jtt.setFromType("SYB");
 jtt.setToType("MM2");

 String atom_type = jtt.translate("N.3");
 System.out.println("N.3 -> "+atom_type);

実行結果:
 N.3 -> 8

mol2の'N.3'はmm2では'8'と変換されました。
変換自体は、joelib/data/plain/types.txtを参照して行われているようです。このtypes.txtはいろいろと参考になると思います。


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posted by わばのり at 17:05| Comment(0) | TrackBack(0) | JOELib | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする

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