logPとTPSAの計算

OpenBabel2.1.0になって、エネルギー計算を筆頭に有益な機能がいくつか追加されているようです。

今回は、logPとTPSAを計算してみます。

ob_exp1.cpp


私の環境では、コンパイルを次のようにして行いました。
　
　$ g++ -I/usr/local/include/openbabel-2.0 -L/usr/local/lib ob_exp1.cpp -lopenbabel

実行

　$ ./a.out
LogP 1.3922
TPSA 20.23

あと、PDBをfasta形式で出力できるようになってました。

　$ babel -ipdb input.pdb -ofsa output.fsa

単純な変換ですが、便利だと思います。